Wenn man z.B. beim bootstrap von Flux die Services für image-reflector-controller und image-automation-controller vergessen hat und diese nachinstallieren möchte, dann wird man zumindest in der offiziellen Doku nicht so recht darauf hingewiesen.
Die Lösung ist dann doch relativ einfach: in eurem Flux Ordner folgendes (natürlich für euer System angepasst) ausführen und anschließend per git commiten/pushen:
flux install \
--components-extra image-reflector-controller,image-automation-controller \
--export > ./clusters/my-cluster/flux-system/gotk-components.yaml